系統・進化論文紹介2025（後生動物Metazoa）
後生動物Metazoaの初期の系統・進化に関する、2025年に出版された論文（一部プレプリント・書籍等が入る場合もあり）を出版月ごとになるべく網羅的に紹介しています。比較的、管理人の興味（主に門レベル以上の系統）に偏っています。もし明らかな抜けがあれば、GitHub Issuesまたはメール（mz9862.github@gmail.com）にて報告していただけると幸いです。論文タイトルはなるべく原文の意味からずれないように直訳することを心掛けているので、日本語にすると不自然なところも多いです。
12月
「『統合ゲノム系統学』は誤差の要因を統合してしまっている」（eLetter・閲覧可能）
“Integrative Phylogenomics” Integrates Sources of Error (Whelan, 2025, Science)
DOI
「系統のスケッチ，抽出，レイアウト」（オープンアクセス）
Sketch, capture and layout phylogenies (Huson, 2025, PLOS Computational Biology)
DOI
「分類群および遺伝子のサンプリングの改善により，オビムシ類（腹毛動物）内部の深部系統関係に関する理解が前進する」（オープンアクセス）
Improved taxonomic and gene sampling advance the knowledge of deep relationships within Macrodasyida (Gastrotricha) (Cesaretti et al., 2025, Cladistics)
DOI
「地球における海綿動物の起源と進化：ハイブリッド型システマティック文献レビューおよび計量書誌学的解析」（国際会議論文・オープンアクセス）
The Origin and Evolution of Sponges on Earth: A Hybrid Systematic Literature Review and Bibliometric Analysis (Daulay, 2025, Proceedings of ICSEST 2025— International Conference on Studies in Engineering, Science, and Technology, ISTES)
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「中央インド・ヴィンディヤ盆地の新原生代前期のSirbu頁岩部層（上部ヴィンディヤ層群）からの，微生物マットに伴う新たな痕跡様構造」
New trail-like features associated with microbial mats from the early Neoproterozoic Sirbu Shale Member (Upper Vindhyan Group), Vindhyan Basin, central India (Choudhuri et al., 2025, Australian Journal of Earth Sciences)
DOI
「18Sの系統的配置の正確性を評価し，初期に分岐した動物に潜む隠れた多様性を明らかにする」（プレプリント・閲覧可能）
Evaluating 18S Phylogenetic Placement Accuracy to Uncover Hidden Diversity in Early Branching Animals (Arano-Ansola et al., 2025 preprint, bioRxiv)
DOI
「海綿動物，有櫛動物，そしてシンテニーの統計的有意性」（オープンアクセス）
Sponges, ctenophores and the statistical significance of syntenies (Copley, 2025, Molecular Biology and Evolution)
DOI
「系統的支持の詳細解析：統合崩壊指数，AU検定，および枝・サイト特異的可視化．」（プレプリント・閲覧可能）
Dissecting Phylogenetic Support: Unified Decay Indices, AU Tests, and Branch-Site Specific Visualizations. (McInerney et al., 2025 preprint, bioRxiv)
DOI
「生命の系統を描く」（書評）
Painting the phylogeny of life (Wong, 2025, Science)
DOI
「軟体性の化石と三次元の化石を組み合わせて，初期のLingulellotretidae科の腕足動物の進化的変化を明らかにする」（オープンアクセス）
Combining soft-bodied and three-dimensional fossils to reveal evolutionary modifications in early lingulellotretid brachiopods (Chen et al., 2025, Communications Biology)
DOI
「モロッコのオルドビス紀前期のFezouata生物相からの，新たな巨大な遊泳底生性のラディオドンタ類の底生生物食者」（オープンアクセス）
A new giant nektobenthic radiodont benthivore from the Early Ordovician Fezouata Biota in Morocco (Potin et al., 2025, Acta Palaeontologica Polonica)
DOI
11月
「腹毛動物の進化的関係のゲノム系統学的枠組み」（プレプリント・ResearchGateから全文のPDFが入手可能）
A Phylogenomic Framework of Gastrotricha Evolutionary Relationships (Wallnoefer et al., 2025 preprint, SSRN)
DOI
ResearchGate全文PDF
「PhyloSuite v2：分子による分岐年代推定解析およびその他の高度な機能のための，オールインワンで効率的かつ可視化指向の統合ツールの開発」（オープンアクセス）
PhyloSuite v2: The development of an all-in-one, efficient and visualization-oriented suite for molecular dating analysis and other advanced features (Zhao et al., 2025, iMeta)
DOI
「分子系統および豊富な24-イソプロピルコレステロール（24-ipcステロール）により明らかになった，新たな普通海綿類の目，Vilesida」（オープンアクセス）
Vilesida, a new order of demosponges revealed by molecular phylogeny and abundant 24-isopropylcholesterols (24-ipc sterols) (Díaz et al., 2025, Zoological Journal of the Linnean Society)
DOI
「PhyloSmewを用いた系統推論ツールの性能評価」（オープンアクセス）
Performance Assessment of Phylogenetic Inference Tools using PhyloSmew (Höhler et al., 2025, Bioinformatics Advances)
DOI
「『Avaloniaのエディアカラン系からの新種Charnia brasieriの記載を含む，エディアカラン紀の属Charniaにおける形状の成長と異質性』［Precambrian Res. (2025) 107947］に対する正誤表」（オープンアクセス）
Corrigendum to “Growth and disparity of form in the Ediacaran genus Charnia, with description of Charnia brasieri sp. nov. from the Ediacaran of Avalonia”. [Precambrian Res. (2025) 107947] (McIlroy et al., 2025, Precambrian Research)
DOI
「中国南部からのエディアカラン紀末期のTongshanラーガーシュテッテ」（オープンアクセス）
The terminal Ediacaran Tongshan Lagerstätte from South China (Hou et al., 2025, Nature Communications)
DOI
「生物間の系統関係のゲノム系統学的推論のための堅牢かつ効率的な信頼限界」（オープンアクセス）
Robust and Efficient Confidence Limits for Phylogenomic Inference of Organismal Relationships (Sharma & Kumar, 2025, Molecular Biology and Evolution)
DOI
「タフォノミー実験により平板動物の化石化の可能性が明らかになる」
TAPHONOMIC EXPERIMENTS SHED LIGHT ON FOSSILIZATION POTENTIAL OF PLACOZOA (Naimark et al., 2025, PALAIOS)
DOI
「MEGA 12.1：macOSおよびLinuxオペレーティングシステム向けクロスプラットフォームリリース」
MEGA 12.1: Cross-Platform Release for macOS and Linux Operating Systems (Stecher et al., 2025, Journal of Molecular Evolution)
DOI
「統合ゲノム系統学により，海綿動物が動物系統樹の根に位置づけられる」（オープンアクセス）
Integrative phylogenomics positions sponges at the root of the animal tree (Steenwyk & King, 2025, Science)
DOI
「ゲノム系統学的不一致を吸収除去する」（オープンアクセス）
Sponging away phylogenomic incongruence (Mulhair & Redmond, 2025, Science)
DOI
「ゲノムの収斂進化により陸生動物の出現が形作られた」（オープンアクセス）
Convergent genome evolution shaped the emergence of terrestrial animals (Wei et al., 2025, Nature)
DOI
「モロッコからのオルドビス紀前期のウミサソリ類により，ウミサソリ類のカンブリア紀における起源と主要な多様化が示唆される」（オープンアクセス）
Early Ordovician sea scorpions from Morocco suggest Cambrian origins and main diversification of Eurypterida (Van Roy et al., 2025, Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences)
DOI
「シンクロトロンX線トモグラフィーにより，謎めいた嚢頭類の汎甲殻類内での系統的類縁性が明らかになる」（オープンアクセス）
Synchrotron X-ray tomography sheds light on the phylogenetic affinities of the enigmatic thylacocephalans within Pancrustacea (Laville et al., 2025, Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences)
DOI
「ディノキドン類の系統のjoint estimationに連続的形質を組み込む」
Incorporating continuous characters in joint estimation of dicynodont phylogeny (Wynd et al., 2025, Systematic Biology)
DOI
「ミトコンドリア遺伝子の系統的不一致は，ミトコンドリア染色体上の位置と機能に関連している」（オープンアクセス）
Mitochondrial gene phylogenetic incongruencies are linked to chromosomal position and function (DeSalle & Tessler, 2025, Genome Biology and Evolution)
DOI
「体系生物学の75年：過去を振り返り，未来へ進む」
Seventy-five Years of Systematic Biology: Looking Back, Moving Forward (Landis & Donoghue, 2025, Systematic Biology)
DOI
「ゲノム系統学により育児嚢を持つ甲殻類の単系統性が支持される：直接発生への道」（プレプリント・閲覧可能）
Phylogenomics supports monophyly of marsupial crustaceans: a journey to direct development (Barta et al., 2025 preprint, bioRxiv)
DOI
「離散形質の形質進化における断続モデルと連続時間モデルの区別および大進化理論への意味合い」（オープンアクセス）
Distinguishing punctuated and continuous-time models of character evolution for discrete characters and the implications for macroevolutionary theory (Wright & Wagner, 2025, Paleobiology)
DOI
「捕食者と被食者のスケーリング則により，カンブリア紀の葉足動物における懸濁物食性の生活様式が支持される」（プレプリント・閲覧可能）
Predator-prey scaling laws support a suspension-feeding lifestyle in Cambrian lobopodians (Richards & Ortega-Hernández, 2025 preprint, bioRxiv)
DOI
「箒虫動物のゲノムにより単系統の触手冠動物が支持される」（オープンアクセス）
Phoronid genome supports a monophyletic Lophophorata (Lewin et al., 2025, Current Biology)
DOI
「存在しない異物同名関係のため無効とされた門名Dendrobrachia Xian-Guan, Bergström, Xio-Ya and Jie 2006（カンブリア紀前期のPhlogites）の復活」
Resurrection of phylum name Dendrobrachia Xian-Guan, Bergström, Xio-Ya and Jie 2006 (Lower Cambrian Phlogites) invalided for an inexistent homonymy (Pérez & Gomes, 2025, Zootaxa)
DOI
「系統樹思考の初心者ガイド」（書評・Blueskyでの著者の投稿のURLからダウンロード不可のバージョンにアクセス可能）
A beginner’s guide to tree thinking (Allen, 2025, Nature Ecology & Evolution)
DOI
Blueskyの著者の投稿
「アンティアトラス山脈からの管状化石の最初の証拠：エディアカラン紀後期の管状化石の古地理およびアンティアトラス山脈におけるエディアカラン系とカンブリア系の境界への洞察」
First evidence of tubular fossils from the Anti-Atlas: Insights into the paleogeography of Late Ediacaran tubular fossils and the Ediacaran–Cambrian boundary in the Anti-Atlas (Beraaouz & El Kabouri, 2025, Precambrian Research)
DOI
「中国のカンブリア紀前期のXiaoshibaラーガーシュテッテからの新たなフデイシ類（翼鰓類）」（オープンアクセス）
A new graptolite (Pterobranchia) from the early Cambrian Xiaoshiba Lagerstätte of China (Yang et al., 2025, Swiss Journal of Palaeontology)
DOI
10月
「サイト間の組成不均質性のモデル化によりアリ類の大系統は解決される：Boudinot & Lieberman (2025) への返信」（オープンアクセス）
Modelling among-site compositional heterogeneity resolves ant backbone phylogeny: A reply to Boudinot & Lieberman (2025) (Cai, 2025, Palaeoentomology)
DOI
「Avaloniaのエディアカラン系からの新種Charnia brasieriの記載を含む，エディアカラン紀の属Charniaにおける形状の成長と異質性」（オープンアクセス）
Growth and disparity of form in the Ediacaran genus Charnia, with description of Charnia brasieri sp. nov. from the Ediacaran of Avalonia (McIlroy et al., 2025, Precambrian Research)
DOI
「三次元的な堆積物の掘削行動の出現により，エディアカラン紀からカンブリア紀への生態系の転換が明らかになる」（オープンアクセス）
Advent of three-dimensional sediment exploration reveals Ediacaran-Cambrian ecosystem transition (Chen & Liu, 2025, Science Advances)
DOI
「祖先的なボディプランにおける高度な適応戦略：5億1000万年前のLeptomitidae科の海綿動物からの洞察」（オープンアクセス）
Advanced adaptive strategies in an ancestral body plan: insights from a 510-Ma-old leptomitid sponge (Luo et al., 2025, Royal Society Open Science)
DOI
「化石データからの系統的および大進化学的推論における形質進化モデルの影響の評価」（オープンアクセス）
Assessing the impact of character evolution models on phylogenetic and macroevolutionary inferences from fossil data (Wright & Hopkins, 2025, Palaeontology)
DOI
「シナプスタンパク質の進化的起源および進化を通じた様々な生物におけるそれらの変化する役割」（Blueskyでの著者の投稿のURLからダウンロード不可のバージョンにアクセス可能）
The evolutionary origins of synaptic proteins and their changing roles in different organisms across evolution (Colgren & Burkhardt, 2025, Nature Reviews Neuroscience)
DOI
Blueskyの著者の投稿
「オホーツク海からの深海性の箒虫動物の初記録：新種Phoronopsis deprofundisの記載および海洋群集の箒虫動物化」
First record of deep-sea phoronids from the Sea of Okhotsk with description of Phoronopsis deprofundis sp.nov. and phoronidization of the ocean communities (Neklyudov et al., 2025, Progress in Oceanography)
DOI
「珍無腸形動物の生殖孔形成からの分子的証拠により，左右相称動物の肛門との相同性が支持される」（オープンアクセス）
Molecular evidence from xenacoelomorph gonopore formation supports homology with the bilaterian anus (Andrikou et al., 2025, Nature Ecology & Evolution)
DOI
「系統解析における形質recoding法の尤度ベースの評価」（プレプリント・閲覧可能）
Likelihood-based evaluation of character recoding schemes for phylogenetic analysis (Seo & Thorne, 2025 preprint, bioRxiv)
DOI
「ミトコンドリアおよびリボソーム遺伝子マーカーを用いた，新皮類の系統における樹形的変動性の評価」（オープンアクセス）
Evaluating topological variability in Neodermata phylogenies using mitochondrial and ribosomal gene markers (Caña-Bozada et al., 2025, PLoS One)
DOI
「現生頭索動物の出現における系統的不一致と遺伝子的革新」（プレプリント・閲覧可能）
Phylogenetic discordance and genic innovation at the emergence of modern cephalochordates (Lotharukpong et al., 2025 preprint, bioRxiv)
DOI
「4億8000万年前の寄生性のスピオ科環形動物」（オープンアクセス）
A 480 million year old parasitic spionid annelid (Nanglu et al., 2025, iScience)
DOI
「系統を再構築するにはいくつの形質が必要か」
How many characters are needed to reconstruct a phylogeny? (Capobianco, 2025, Biology Letters)
DOI
「あらゆる基盤をカバー：ゲノム系統学を身近にするための，後生動物の普遍的なUCEプローブセット」（オープンアクセス）
Covering all bases: a universal Metazoan UCE probe set to democratize phylogenomics (Derkarabetian et al., 2025, Genome Biology and Evolution)
DOI
「Ægir-Iapetus古地理によって形作られた初期の有棘類の多様化：北グリーンランド（シリーズ2，ステージ4）からの洞察」
Early aculiferan diversification shaped by Ægir-Iapetus palaeogeography: Insights from North Greenland (Series 2, Stage 4) (Oh et al., 2025, Palaeogeography, Palaeoclimatology, Palaeoecology)
DOI
「アリ類の系統はサイト不均質モデルの適用では解決されない」（オープンアクセス）
Ant phylogeny is not resolved by the application of site heterogeneous models (Boudinot & Lieberman, 2025, Communications Biology)
DOI
「系統樹のベイズ推論は相関した離散的形態形質により誤導されない」（オープンアクセス）
Bayesian inference of phylogenetic trees is not misled by correlated discrete morphological characters (Liu & Zhang, 2025, Paleobiology)
DOI
「SalterellaとVolborthellaの刺胞動物との類縁性：殻の進化への意味合い」（オープンアクセス）
A Cnidarian affinity for Salterella and Volborthella: implications for the evolution of shells (Vayda et al., 2025, Journal of Paleontology)
DOI
「隠された繋がりを明らかに：半索動物と脊椎動物は驚くべきミトコンドリアの類似性を共有する」（オープンアクセス）
Unveiling the hidden connection: Hemichordates and vertebrates share surprising mitochondrial similarities (Guo et al., 2025, Heliyon)
DOI
「ゲノム時代における細胞質と核の不一致の再考」
Reconsidering cytonuclear discordance in the genomic age (Larson et al., 2025, Evolution)
DOI
「カンブリア紀前期のGuanshan BiotaからのCorynetisの新たな観察結果は，穴を掘る生活を反映している」（オープンアクセス）
New observation on Corynetis from the early Cambrian Guanshan Biota reflect burrowing life (Liu & Liu, 2025, Royal Society Open Science)
DOI
「系統生物学」（オンライン書籍［教科書］・オープンアクセス）
Phylogenetic Biology (Dunn, 2025)
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「なぜ系統学を用いずに新たな分類群を記載すべきではないか．Chen et al. (2025) へのコメント」（ResearchGateから全文のPDFが入手可能）
Why we should not describe new taxa without using phylogenetics. Comment on Chen et al. (2025) (Zhang & Feng, 2025, Journal of Natural History)
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ResearchGate全文PDF
「Anastrepha（双翅類：ミバエ科）の系統的に有益なマーカーセットの特定」（オープンアクセス）
Identifying sets of phylogenetically informative markers for Anastrepha (Diptera: Tephritidae) (de Brito et al., 2025, Scientific Reports)
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「新属新種Oura megale，デルタ型の尾部を持つ，カンブリア紀前期の大型のdeuteropod」（オープンアクセス）
Oura megale n. gen. n. sp., a large early Cambrian deuteropod with a delta-shaped tailpiece (O’Flynn et al., 2025, Palaeontologia Electronica)
DOI
「カンブリア紀前期のGuanshan Biotaからの新たなカイメン類（Ascospongiae）」
A new sponge (Ascospongiae) from the early Cambrian Guanshan Biota (Zou et al., 2025, Palaeoworld)
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「最初のヒル類の体化石は，推定されているヒル類の起源年代よりも2億年古い」（オープンアクセス）
The first leech body fossil predates estimated hirudinidan origins by 200 million years (de Carle et al., 2025, PeerJ)
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9月
「冠輪動物の進化と系統」（書籍のチャプター）
Evolution and Phylogeny of Lophotrochozoa (Barroso & Contins, 2025, Encyclopedia of Evolutionary Biology (Second Edition), Elsevier)
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「total-evidenceの年代推定における大量絶滅の影響と検出可能性の評価」（プレプリント・閲覧可能）
Evaluating the impact and detectability of mass extinctions on total-evidence dating (Du et al., 2025 preprint, bioRxiv)
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「Athyridida（腕足動物）の系統：推論方法の比較」（オープンアクセス）
Phylogeny of Athyridida (Brachiopoda): a comparison of methods of inference (Carlson et al., 2025, Journal of Paleontology)
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「顕生代を通じた海洋生物多様性の駆動要因の解明」（オープンアクセス）
Unravelling the drivers of marine biodiversity across the Phanerozoic (Balembois et al., 2025, Nature Communications)
DOI
「有爪動物の系統学的研究の再調査により，チクシュルーブ衝突イベントに対する土壌生態系の回復力が明らかになる」（オープンアクセス）
A Review of Onychophoran Phylogenic Studies Reveals Resilience of Soil Ecosystems to the Chicxulub Impact Event (Monge-Nájera & Añino, 2025, Fossil Studies)
DOI
「古生物学における重要な問いの特定：コミュニティ主導のプロジェクト」（オープンアクセス）
Identifying the Big Questions in paleontology: a community-driven project (Smith et al., 2025, Paleobiology)
DOI
「有鱗類における進化速度の不一致により，進化的新規性と革新の対照的なパターンが明らかになる」（オープンアクセス）
Evolutionary rate incongruences in squamates reveal contrasting patterns of evolutionary novelties and innovation (Simões et al., 2025, Systematic Biology)
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「カンブリア紀ステージ4のマイクロバイアライトからの，層孔虫類様の堆積物凝集性のカイメン類」（プレプリント・閲覧可能）
A stromatoporoid-like sediment-agglutinating sponge from microbialites of Cambrian Stage 4 (Luo et al., 2025 preprint, bioRxiv)
DOI
「カイメン類由来のC31ステロールおよび新原生代の化石ステラン対照物の化学的特徴づけ」
Chemical characterization of C31 sterols from sponges and Neoproterozoic fossil sterane counterparts (Shawar et al., 2025, Proceedings of the National Academy of Sciences)
DOI
「分子系統樹上でのシマミズウドンゲUrnatella gracilis Leidy, 1852の位置により，群体性の内肛動物の体系学に関する見解が変化する」（オープンアクセス）
The position of Urnatella gracilis Leidy, 1852 on the molecular phylogenetic tree changes the view on the systematics of colonial Entoprocta (Borisanova & Ekimova, 2025, Invertebrate Zoology)
DOI
「系統学における化石末端年代法の実践ガイドおよび総説」（オープンアクセス）
Practical Guide and Review of Fossil Tip-Dating in Phylogenetics (Heckeberg et al., 2025, Systematic Biology)
DOI
「突破口：体が2回対称から5回対称へと進化した過程を示す化石の手掛かり」
Head start: fossil clues about how bodies evolved from two-fold to five-fold symmetry (Wray, 2025, Nature)
DOI
「分岐した剛毛，あるいは付着した大型藻類：カンブリア紀前期の澄江ラーガーシュテッテからの例外的に保存された腕足動物の事例研究」（オープンアクセス）
Branched Setae or Attached Macroalgae: A Case Study of an Exceptionally Preserved Brachiopod from the Early Cambrian Chengjiang Lagerstätte (Liang et al., 2025, Biology)
DOI
「ユタ州のカンブリア系（ミャオリンギアン，ウリューアン）からの未詳な軟体性の化石」（オープンアクセス）
A problematic soft-bodied fossil from the Cambrian (Miaolingian, Wuliuan) of Utah (Kimmig et al., 2025, Geological Magazine)
DOI
「HIPSTR：TreeAnnotator Xにおける最高独立事後部分木再構築」（オープンアクセス）
HIPSTR: highest independent posterior subtree reconstruction in TreeAnnotator X (Baele et al., 2025, Bioinformatics)
DOI
「大量絶滅が顎口脊椎動物とその近縁群（顎口類）の初期の放散を引き起こした」（プレプリント・閲覧可能）
Mass Extinction Triggered the Early Radiations of Jawed Vertebrates and Relatives (Gnathostomes) (Hagiwara & Sallan, 2025 preprint, bioRxiv)
DOI
「固着性のポリプ状のdinomischids（ステム有櫛動物）として再解釈された最古の多様なクラゲ相」（オープンアクセス）
The oldest diverse jellyfish fauna reinterpreted as sessile polypoid dinomischids (stem-group Ctenophora) (Parry et al., 2025, Journal of Systematic Palaeontology)
DOI
「ジョージナ盆地南東部（オーストラリア，クイーンズランド州）の，カンブリア紀シリーズ2（ステージ4）からミャオリンギアン（ウリューアン）のThorntonia Limestoneの生物層序および対比」（オープンアクセス）
Biostratigraphy and correlation of the Cambrian Series 2 (Stage 4) to Miaolingian (Wuliuan) Thorntonia Limestone, south-eastern Georgina Basin (Queensland, Australia) (Betts et al., 2025, Papers in Palaeontology)
DOI
「動物の系統分類進化学」（書籍［教科書］・日本語）
（朝倉ら編，2025，丸善出版）
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「『バタフライアニマル』，新属新種Papiliomaris kluessendorfae：Waukesha biotaからの二枚の殻を持つ謎めいた節足動物」（オープンアクセス）
The ‘butterfly animal,’ Papiliomaris kluessendorfae n. gen. n. sp.: An enigmatic bivalved arthropod of the Waukesha biota (Anderson et al., 2025, Journal of Paleontology)
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「ニューファンドランド島（カナダ）のエディアカラン系からの新属新種大型化石Lydonia jiggamintia：偽化石から後生動物グレードの生物へ」（オープンアクセス）
The macrofossil Lydonia jiggamintia gen. et sp. nov. from the Ediacaran of Newfoundland (Canada): From pseudofossil to metazoan-grade organism (Pasinetti et al., 2025, Palaeontologia Electronica)
DOI
「祖先多型のソーティングおよびそれの形態系統学と大進化への影響」（オープンアクセス）
Sorting of ancestral polymorphism and its impact on morphological phylogenetics and macroevolution (Parins-Fukuchi, 2025, Evolution)
DOI
「中国南部のカンブリア紀前期のQingxi Formationからの珪質のカイメン化石」
Siliceous sponge fossils from the early Cambrian Qingxi Formation in South China (Cao et al., 2025, Palaeoworld)
DOI
「additive codingは形態系統解析に有用か？実証的評価」（オープンアクセス）
Is additive coding useful for morphological phylogenetic analyses? An empirical evaluation (Ament & Almeida, 2025, Arthropod Systematics & Phylogeny)
DOI
「動物における後口動物の枝に対する証拠の検討および脊索動物の起源の理解への意味合い」（オープンアクセス）
Weighing the Evidence for a Deuterostome Branch of Animals and Implications for Understanding Chordate Origins (Telford, 2025, Annual Review of Ecology, Evolution, and Systematics)
DOI
「今何時？系統樹と化石の相互作用」（プレプリント・閲覧可能）
What time is it? Interactions between trees and fossils (Carruthers, 2025 preprint, EcoEvoRxiv)
DOI
「sparse learningによる系統的に有益なアライメント座位の効率的な識別」（プレプリント・閲覧可能）
Efficient Identification of Phylogenetically Informative Alignment Sites via Sparse Learning (Schrago, 2025 preprint, bioRxiv)
DOI
「ミトコンドリアのCO1および16S rRNA遺伝子配列に基づく多毛類の系統解析」（オープンアクセス）
A phylogenetic analysis of the polychaeta based on mitochondrial CO1 and 16S rRNA gene sequences (Corpuz et al., 2025, Journal of Applied Biological Sciences)
DOI
「Termal：高速かつインタラクティブなターミナルベースのマルチプルアライメントビューア」（オープンアクセス）
Termal: a fast and interactive terminal-based viewer for multiple sequence alignments (Junier, 2025, Bioinformatics Advances)
DOI
8月
「カンブリア爆発はいかにして起こったか：科学史と生命史における偶然性」
How the cambrian exploded: Contingency in the history of science and life (Dresow, 2025, Studies in History and Philosophy of Science)
DOI
「古生代初期からのSkolithos linearis：鰓曳動物の巣穴？」
Skolithos linearis from the early Palaeozoic: The burrow of a priapulid? (Knaust, 2025, Palaeogeography, Palaeoclimatology, Palaeoecology)
DOI
「組み換えと系統推論」（オープンアクセス）
Recombination and phylogenetic inference (Rannala, 2025, Evolutionary Journal of the Linnean Society)
DOI
「動物分類学と古生物学」（随筆・日本語・オープンアクセス）
（西・馬渡，2025，タクサ：日本動物分類学会誌）
DOI
「ヤムシ類の理解しがたいボディプランが解読された」
The perplexing body plan of arrow worms decoded (Lewin & Luo, 2025, Nature)
DOI
カラー図解 水の中の小さな美しい生き物たち: 小型ベントス・プランクトン百科（書籍［図鑑］・日本語）
（仲村ほか編，2025，朝倉書店）
Amazon URL
「JOGSラーガーシュテッテ：Nama Groupからのエディアカラン紀の軟体性の化石」
JOGS Lagerstätten: Ediacaran soft-bodied fossils from the Nama Group (Darroch et al., 2025, Journal of the Geological Society)
DOI
「形質の大進化に関する変わりゆく見解」（プレプリント・閲覧可能）
An evolving view of character macroevolution (Tribble et al., 2025 preprint, EcoEvoRxiv)
DOI
「3Di形質をアミノ酸データセットに加えると解像度が向上する可能性があるが，その効果は短いタンパク質やαヘリックスタンパク質では弱くなる」（プレプリント・閲覧可能）
Adding 3Di characters to amino acid datasets can improve resolution, but the effect is weaker in shorter and alpha-helical proteins (Fullmer et al., 2025 preprint, bioRxiv)
DOI
「二胚葉動物Nematostella vectensisにおける内胚葉と中胚葉の胚葉アイデンティティの分離」（オープンアクセス）
Segregation of endoderm and mesoderm germ layer identities in the diploblast Nematostella vectensis (Haillot et al., 2025, Nature Communications)
DOI
「occurrence birth-death diffusion process：化石と不均一な速度で多様化史を解明する」（プレプリント・閲覧可能）
The Occurrence Birth-Death Diffusion Process: Unraveling Diversification Histories with Fossils and Heterogeneous Rates (Andréoletti et al., 2025 preprint, bioRxiv)
DOI
「系統的支持の評価における新たな視点：新たなRelative Contradiction Indexを用いてワニ類における系統的論争を調査する」
New perspectives in phylogenetic support assessment: using the new Relative Contradiction Index to investigate the phylogenetic controversies in Crocodylia (Aubier et al., 2025, Systematic Biology)
DOI
「タンパク質構造の系統学」（オープンアクセス）
Protein Structural Phylogenetics (Puente-Lelievre et al., 2025, Genome Biology and Evolution)
DOI
「異甲類（ステム顎口類）の系統」（オープンアクセス）
A phylogeny for Heterostraci (stem-gnathostomes) (Randle et al., 2025, Papers in Palaeontology)
DOI
「カンブリア紀の化石Jianfengia multisegmentalisの脳の解剖学的構造により、真節足動物の系統が解明される」（オープンアクセス）
Brain anatomy of the Cambrian fossil Jianfengia multisegmentalis informs euarthropod phylogeny (Strausfeld et al., 2025, Nature Communications)
DOI
「珪質のカンブリア紀の微化石における分類学的曖昧さの解決：Blastulospongiaの海綿動物としての類縁性とarchaeospicularians（放散虫類）の系統」（オープンアクセス）
Resolution of taxonomic ambiguities among siliceous Cambrian microfossils: poriferan affinity of Blastulospongia and phylogeny of archaeospicularians (Radiolaria) (Sheng & Aitchison, 2025, Journal of Paleontology)
DOI
「ゲノム系統解析における影響と不一致の尺度について」（オープンアクセス）
On measures of influence and discordance in phylogenomic analyses (Jiao & Yang, 2025, Evolutionary Journal of the Linnean Society)
DOI
「エディアカラン紀のコプロスタンのバイオマーカーの再評価およびDickinsoniaへの意味合い」（オープンアクセス）
A Reassessment of the Coprostane Biomarker in the Ediacaran With Implications for Dickinsonia (Mulligan & Gold, 2025, Geobiology)
DOI
「昆虫のゲノム系統学：実験計画から系統解析後の解析まで」（書籍のチャプター）
Insect Phylogenomics: From Experiment Planning to Post-phylogenetic Analyses (Forni et al., 2025, Insect Genomics. Methods in Molecular Biology, Humana)
DOI
「新たなデータフィルタリング法により、軟骨魚類の系統の論争が解決される」（プレプリント・閲覧可能）
A novel data filtering method resolves the controversy in the phylogeny of the Chondrichthyes (Huang et al., 2025 preprint, bioRxiv)
DOI
「ミトゲノムによるホタル科の系統推定と分岐年代に対するpartition modelsの影響」（プレプリント・閲覧可能）
Impact of Partition Models on Phylogenetic Inference and Divergence Times of Lampyridae from Mitochondrial Genomes (Höhna et al., 2025 preprint, bioRxiv)
DOI
「頭足類の体の大きさとマクロ生態学の長期的変化」（オープンアクセス）
Cephalopod body size and macroecology through deep time (Klug et al., 2025, Scientific Reports)
DOI
「カンブリア紀の放散および顕生代最初の大量絶滅（Cambrian Sinsk Event）における後生動物の機能的多様性の変動」（オープンアクセス）
Changes in metazoan functional diversity across the Cambrian Radiation and the first Phanerozoic mass extinction: the Cambrian Sinsk Event (Murphy et al., 2025, Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences)
DOI
「翼鰓類（半索動物）における相称性の進化」
The evolution of symmetry in the Pterobranchia (Hemichordata) (Maletz, 2025, Zootaxa)
DOI
「エディアカラン紀のDoushantuo Formationからのリン酸塩化した胚様微化石の例外的な保存における燐灰石のナノ結晶へのアモルファスシリカ被膜の役割」（オープンアクセス）
The role of amorphous silica coating on apatite nanocrystals in the exceptional preservation of phosphatized embryo-like microfossils from the Ediacaran Doushantuo Formation (Lee et al., 2025, Geology)
DOI
「エディアカラン紀の初期の動物の寿命を制約する」（オープンアクセス）
Constraining the lifespans of early animals of the Ediacaran (Mitchell & Dhungana, 2025, Biology Letters)
DOI
「エディアカラン紀の生物の移動性：総説」（オープンアクセス）
Mobility of Ediacaran organisms: A review (Retallack, 2025, Journal of the Palaeontological Society of India)
DOI
「古生物学：初期の棘皮動物を整理する」
Palaeontology: Straightening out early echinoderms (Budd, 2025, Current Biology)
DOI
「左右相称動物のゲノム構造の保存は例外であり、規則ではない」（オープンアクセス）
Conservation of bilaterian genome structure is the exception, not the rule (Lewin et al., 2025, Genome Biology)
DOI
「形態データの有無両方で化石分類群を組み合わせることで、年代付けされた系統解析が改善される」（オープンアクセス）
Combining fossil taxa with and without morphological data improves dated phylogenetic analyses (Nikolic et al., 2025, Biology Letters)
DOI
「完全な生命の樹全体にわたる系統的多様性」（プレプリント・閲覧可能）
Phylogenetic Diversity Across the Complete Tree of Life (Guo et al., 2025 preprint, bioRxiv)
DOI
「サイト間の進化的変動のモデル化の改善のための非有限な混合モデル」（オープンアクセス）
Infinite Mixture Models for Improved Modeling of Across-Site Evolutionary Variation (Gill et al., 2025, Molecular Biology and Evolution)
DOI
「毛顎動物の独特なボディプランのゲノム生物学的起源」（オープンアクセス）
The genomic origin of the unique chaetognath body plan (Piovani et al., 2025, Nature)
DOI
「基盤的Epitheliozoaの絶滅クレード：謎めいたカンブリア紀のchancelloriidsの系統的位置と意味合い」（オープンアクセス）
An extinct clade of the basal Epitheliozoa: phylogenetic position and implication of the enigmatic Cambrian chancelloriids (Yun et al., 2025, Communications Biology)
DOI
「顎口脊椎動物の姉妹群における頭部と胴部の接合面の新たな形成様式」（ResearchGateから全文のPDFが入手可能）
Novel assembly of a head–trunk interface in the sister group of jawed vertebrates (Miyashita et al., 2025, Nature)
DOI
ResearchGate全文PDF
「全ゲノムアラインメントのゲノム系統解析におけるAICを用いたウィンドウサイズの選択」（オープンアクセス）
Selecting a Window Size for Phylogenomic Analyses of Whole Genome Alignments using AIC (Ivan et al., 2025, Systematic Biology)
DOI
「GFmixによりサイト・枝間の不均一性をモデル化する」（プレプリント・閲覧可能）
Modeling site-and-branch-heterogeneity with GFmix (McCarthy et al., 2025 preprint, bioRxiv)
DOI
「しかし時計はチクタクと時を刻む：実証的ケーススタディにより、total-evidenceの年代推定におけるrelaxed clock modelsの優位性が強調される」（オープンアクセス）
But the Clock, Tick-Tock: An Empirical Case Study Highlights the Preeminence of Relaxed Clock Models in Total-Evidence Dating (Mongiardino Koch et al., 2025, Systematic Biology)
DOI
「後口動物クレードはアーティファクトか？」（オープンアクセス）
Is the deuterostome clade an artifact? (Serra Silva et al., 2025, Current Biology)
DOI
7月
「piqtree：IQ-TREEによるシームレスな系統推論のためのPythonパッケージ」（プレプリント・閲覧可能）
piqtree: A Python Package for Seamless Phylogenetic Inference with IQ-TREE (McArthur et al., 2025 preprint, bioRxiv)
DOI
「ブラウザ上のClipKIT：系統学のためのマルチプルアライメントの高速なオンラインでのトリミング」（オープンアクセス）
ClipKIT in the browser: fast online trimming of multiple sequence alignments for phylogenetics (Steenwyk et al., 2025, Nucleic Acids Research)
DOI
「カンブリア紀からの最初期の脊椎動物における4つのカメラ眼」（プレプリント・閲覧可能）
Four camera eyes in the earliest vertebrates from the Cambrian (Cong et al., 2025 preprint, Research Square)
DOI
「中国南部、雲南省東部のMalong-Yiliang areaにおけるGuanshan Biota（カンブリア紀、ステージ4）の新たな産出」
New occurrence of the Guanshan Biota (Cambrian, Stage 4) in the Malong-Yiliang area, eastern Yunnan, South China (Yang et al., 2025, Historical Biology)
DOI
「海産無脊椎動物幼生のアトラス 第2版」（書籍）
Atlas of Marine Invertebrate Larvae 2nd Edition (Boyle et al. (eds.), 2025, Academic Press)
DOI
「カンブリア紀のChancelloriida類の骨片における、上皮細胞によって制御された有機テンプレートの例外的な保存」（オープンアクセス）
Exceptionally preserved epithelial cell−controlled organic templates in Cambrian chancelloriid sclerites (Hu et al., 2025, Geology)
DOI
「依存性を持つ形質の最尤法における系統解析」
Phylogenetic Analysis of Characters with Dependencies under Maximum Likelihood (Goloboff, 2025, Systematic Biology)
DOI
「Adoudou生物相：モロッコ・西部アンティアトラス山脈からのエディアカラン紀－カンブリア紀の移行期への新たな窓」
The Adoudou Biota: A new window on the Ediacaran-Cambrian transition from the western Anti-Atlas, Morocco (Azizi et al., 2025, Precambrian Research)
DOI
「複雑な混合モデルを用いた深い時間的スケールの進化の分子時計年代推定」（プレプリント・閲覧可能）
Molecular Clock Dating of Deep-Time Evolution Using Complex Mixture Models (Wang & Meade, 2025 preprint, bioRxiv)
DOI
「ASTER：大規模なゲノム系統学的復元のためのパッケージ」（オープンアクセス）
ASTER: A Package for Large-scale Phylogenomic Reconstructions (Zhang et al., 2025, Molecular Biology and Evolution)
DOI
「Příbram–Jince盆地の下部Jince Formation（カンブリア紀，ミャオリンギアン）からのHallucigenia様葉足動物の初記録」（オープンアクセス）
The first record of Hallucigenia-like lobopodians from the lower Jince Formation (Cambrian, Miaolingian) of the Příbram–Jince Basin (Kovář & Fatka, 2025, Swiss Journal of Palaeontology)
DOI
「グリーンランドのクマムシ類により、頭部の外部感覚器官の新たな形態学的特徴が明らかになる」（オープンアクセス）
Greenlandic water bears reveal a new morphological trait of external head sensory organs (Kihm et al., 2025, Scientific Reports)
DOI
「中国南部、三峡地域のカンブリア系下部Yanjiahe Formationから得られた最初期の海綿動物の骨片の房」
The earliest sponge spicule tufts from the Cambrian Lower Yanjiahe Formation, Three Gorges area, South China (Zhang et al., 2025, Palaeoworld)
DOI
「深海を生き残る：硫化水槽環境における後生動物の回復力」（オープンアクセス）
Surviving the depths: metazoan resilience in sulphidic aquaria environments (Rozanitis et al., 2025, Lethaia)
DOI
「生痕化石の滑らかさの分析：エディアカラン紀からカンブリア紀への移行期における左右相称動物の移動生態を解明するための定量的ツールキットの拡張」（ResearchGateから全文のWordファイルが入手可能）
Smoothness analyses of trace fossils: expanding quantitative toolkits to unravel bilaterian movement ecology during the Ediacaran–Cambrian transition (Wang et al., 2025, Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences)
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ResearchGate全文Word
「エディアカラン紀の謎：先カンブリア時代の古生物学における不確実性と決定不全」
Ediacaran enigma: uncertainty and underdetermination in precambrian paleontology (Dresow, 2025, History and Philosophy of the Life Sciences)
DOI
「ベイズ系統学的、系統地理学的、phylodynamic的推論のためのBEAST X」（オープンアクセス）
BEAST X for Bayesian phylogenetic, phylogeographic and phylodynamic inference (Baele et al., 2025, Nature Methods)
DOI
「グランドキャニオン（アメリカ合衆国、アリゾナ州）からの例外的に保存されたカンブリア紀の生物相における進化的エスカレーション」（オープンアクセス）
Evolutionary escalation in an exceptionally preserved Cambrian biota from the Grand Canyon (Arizona, USA) (Mussini et al., 2025, Science Advances)
DOI
「謎めいた甲殻類y幼生のゲノム系統学により、フジツボにおける寄生性の複数回の起源が明らかになる」（オープンアクセス）
Phylogenomics of Enigmatic Crustacean Y-Larvae Reveals Multiple Origins of Parasitism in Barnacles (Dreyer et al., 2025, Current Biology)
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「WitChi：経験的カイ二乗検定を用いた、ゲノム系統学的アライメントにおける組成的バイアスの効率的な検出と除去」（プレプリント・閲覧可能）
WitChi: Efficient Detection and Pruning of Compositional Bias in Phylogenomic Alignments Using Empirical Chi-Squared Testing (Köstlbacher et al., 2025 preprint, bioRxiv)
DOI
「クモガタ類の脳のカンブリア紀の起源」（オープンアクセス）
Cambrian origin of the arachnid brain (Stausfeld et al., 2025, Current Biology)
DOI
「後生動物 — 動物の形態と進化：動物の解剖および比較研究の実践的手引き」（書籍）
Metazoa – Morphology and Evolution of Animals: A Practical Guide to the Dissection and Comparative Study of Animals (Paululat & Purschke, 2025, Springer Berlin)
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「化石化した腹部神経節により、カンブリア紀のnectocarididsの毛顎動物との類縁性が明らかになる」（オープンアクセス）
A fossilized ventral ganglion reveals a chaetognath affinity for Cambrian nectocaridids (Vinther et al., 2025, Science Advances)
DOI
「Palaeocampa anthrax，石炭紀からの，化学的防御を備えた，装甲を持つ淡水性の葉足動物」（オープンアクセス）
Palaeocampa anthrax, an armored freshwater lobopodian with chemical defenses from the Carboniferous (Knecht et al., 2025, Communications Biology)
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「生命の樹全体にわたる分子と形態進化の速度を明らかにする」（プレプリント・閲覧可能）
Unveiling the tempo of molecular and morphological evolution across the Tree of Life (López-Estrada et al., 2025 preprint, bioRxiv)
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「組み換えを考慮したゲノム系統学」
Recombination-aware phylogenomics (Burbrink et al., 2025, Trends in Ecology & Evolution)
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「OrthoFinder：比較ゲノミクスのためのスケーラブルな系統的orthology推論」（プレプリント・閲覧可能）
OrthoFinder: scalable phylogenetic orthology inference for comparative genomics (Emms et al., 2025 preprint, bioRxiv)
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「骨片の独立起源により、海綿動物の進化史の古生物学的および分子的証拠が調和させられる」（プレプリント・閲覧可能）
Independent origins of spicules reconcile palaeontological and molecular evidence of sponge evolutionary history (Rossi et al., 2025 preprint, bioRxiv)
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「不均一な多様化速度を考慮したfossilized birth deathプロセスにより、Nimravidae（Carnivoraformes）における、多様化と肉食性への特殊化との関係が明らかになる」（プレプリント・閲覧可能）
The Fossilized Birth Death Process with heterogeneous diversification rates unravels the link between diversification and specialisation to a carnivorous diet in Nimravidae (Carnivoraformes) (Chabrol et al., 2025 preprint, bioRxiv)
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「多座系統学における非効率的な重複に対処する」（オープンアクセス）
Coping with Ineffective Overlap in Multilocus Phylogenetics (Silva et al., 2025, Systematic Biology)
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6月
「群体構造を持つ新たなベンド紀の後生動物」
New Vendian Metazoa with Colonial Organization (Luzhnaya, 2025, Paleontological Journal)
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「Historical Biologyにおける系統学的研究」（オープンアクセス）
Phylogenetic studies at Historical Biology (Müller, 2025, Historical Biology)
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「インド，Jodhpur GroupのSonia Sandstoneからのエディアカラン紀の化石：新たな発見と解釈」（オープンアクセス）
Ediacaran fossils from the Sonia Sandstone, Jodhpur Group, India: New discoveries and interpretations (Ahmad & Pandey, 2025, Journal of the Palaeontological Society of India)
DOI
「新たに開発された構造ベースの手法は大規模なゲノム系統学において標準的な配列ベースの手法を上回らない」（オープンアクセス）
Newly Developed Structure-Based Methods Do Not Outperform Standard Sequence-Based Methods for Large-Scale Phylogenomics (Mutti et al., 2025, Molecular Biology and Evolution)
DOI
「構造系統学のための普遍的な置換マトリックス」（オープンアクセス）
A General Substitution Matrix for Structural Phylogenetics (Garg & Hochberg, 2025, Molecular Biology and Evolution)
DOI
「輪形動物の寄生虫の進化における遺伝的・形態学的特徴の大幅な階層的縮小」（オープンアクセス）
Substantial Hierarchical Reductions of Genetic and Morphological Traits in the Evolution of Rotiferan Parasites (Herlyn et al., 2025, Genome Biology and Evolution)
DOI
「希少な進化的イベントにより、直泳動物の環形動物内部における系統的配置が支持される」（オープンアクセス）
Rare Evolutionary Events Support the Phylogenetic Placement of Orthonectida Within Annelida (Nikolaeva et al., 2025, International Journal of Molecular Sciences)
DOI
「エストニアの下部カンブリア系（シリーズ2）からの『鰓曳動物』の可能性があるものの初記録」（オープンアクセス）
The first record of a possible ‘priapulid’ from the lower Cambrian (Series 2) of Estonia (Vinn et al., 2025, Carnets Geol.)
DOI
「鰓脚類の多様化の時間樹的な解決策を目指して：化石年代の事前分布に対するジャックナイフ評価」（オープンアクセス）
Towards a time-tree solution for Branchiopoda diversification: a jackknife assessment of fossil age priors (Rhigetti et al., 2025, Palaeoentomology)
DOI
カンブリア紀から現世までの魚類相の変遷（日本語・オープンアクセス）
Ichthyofaunal Transition from the Cambrian to Recent
（中坊，2025，地学雑誌）
DOI
「離散的形態データセットを用いた系統推定のためのcovarionモデル」（プレプリント・閲覧可能）
A covarion model for phylogenetic estimation using discrete morphological datasets (Khakurel & Höhna, 2025 preprint, bioRxiv)
DOI
「新たなカンブリア紀のステム棘皮動物により、前後軸の進化が明らかになる」（オープンアクセス）
A new Cambrian stem-group echinoderm reveals the evolution of the anteroposterior axis (Woodgate et al., 2025, Current Biology)
DOI
「シルル紀からの初めてのカブトガニ類により、カブトガニ類の基本構造の詳細が明らかになる」（オープンアクセス）
The first Silurian horseshoe crab reveals details of the xiphosuran ground plan (Lamsdell, 2025, Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences)
DOI
「Codexウミサソリ類：一致した最節約法およびベイズ法の系統解析に基づく改訂された分類体系」（オープンアクセス）
Codex Eurypterida: A Revised Taxonomy Based on Concordant Parsimony and Bayesian Phylogenetic Analyses (Lamsdell, 2025, Bulletin of the American Museum of Natural History)
DOI
「初期の鋏角類（Offacolidae）における懸濁物食の仮説」（オープンアクセス）
A Hypothesis on Suspension Feeding in Early Chelicerates (Offacolidae) (Lustri et al., 2025, Diversity)
DOI
「群体制のフデイシ類（半索動物：翼鰓類）における単軸性および仮軸性の成長様式」（オープンアクセス）
Monopodial and Sympodial Growth Modes in the Colonial Graptolithina (Hemichordata, Pterobranchia) (Maletz & Lerosey-Aubril, 2025, Evolution and Development)
DOI
「輻鰭類の系統を深く掘り下げる」
A deep dive into the coelacanth phylogeny (Ferrante & Cavin, 2025, PLOS One)
DOI
ゆびでたどる進化のえほん（書籍［絵本］・日本語）
（三上，2025，KADOKAWA）
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「エディアカラン紀の移動性の生痕化石の形態の定量的解読：細長い前後軸の体形の出現の証拠」（オープンアクセス）
Quantitative decoding of Ediacaran locomotory trace fossil morphologies: Evidence for the emergence of slender anterior-posterior body profiles (Wang & Miguez-Salas, 2025, Geology)
DOI
「Aguinaldo et al. (1997) および進化発生生物学の誕生」
Aguinaldo et al. (1997) and the birth of Evo/Devo (Weisblat, 2025, Developmental Biology)
DOI
5月
「無肺類のクモガタ類の多分岐の解決のための，系統的形質の情報源としてのゲノム構造の探究」
Exploring genome architecture as a source of phylogenetic characters for resolving the apulmonate arachnid polytomy (Klementz et al., 2025, Molecular Phylogenetics and Evolution)
DOI
「雲南省東部における、エディアカラン紀－カンブリア紀の移行期からの後生動物の穿孔行動の進化と革新」
Evolution and innovation of the metazoan burrowing behaviour from Ediacaran-Cambrian transition, eastern Yunnan (Li et al., 2025, Precambrian Research)
DOI
「感覚を持つ歯の構造の進化的起源」（ResearchGateから全文のPDFが入手可能）
The evolutionary origin of sensitive dental structures (Houée & Janvier, 2025, Nature)
DOI
ResearchGate全文PDF
「モデルベースの構造系統学のための3次元3次相互作用の形質のデータセットの生成のためのパイプライン」（プレプリント・閲覧可能）
A Pipeline for Generating Datasets of 3-Dimensional Tertiary Interaction Characters for Model-Based Structural Phylogenetics (Matzke et al., 2025 preprint, OSF Preprint)
DOI
「初期のカブトガニ類における体節形成およびthoracetronの進化」（オープンアクセス）
Segmentation in early Xiphosura and the evolution of the thoracetron (Lamsdell & Ocon, 2025, Journal of Paleontology)
DOI
「Weighted TREE-QMCによる，遺伝子系統樹の不完全性，推定誤差，体系的な相同性の誤りへの頑健性の向上」
Improved Robustness to Gene Tree Incompleteness, Estimation Errors, and Systematic Homology Errors with Weighted TREE-QMC (Han & Molloy, 2025, Systematic Biology)
DOI
「完全なプランクトン性の生活環への独立した移行により、表層域におけるクラゲ類の全球的な分布が形作られた」
Independent transitions to fully planktonic life cycles shaped the global distribution of medusozoans in the epipelagic zone (Boosten et al., 2025, Proceedings of the National Academy of Sciences)
DOI
「古代のカブトガニ類における卵巣の例外的な保存」（オープンアクセス）
Exceptionally preserved ovaries in an ancient horseshoe crab (Lamsdell et al., 2025, Geology)
DOI
「小さなカンブリア紀のステム大顎類により、初期の真節足動物における付属肢の節融合と特殊化の独立した進化が明らかになる」（オープンアクセス）
A tiny Cambrian stem-mandibulate reveals independent evolution of limb tagmatization and specialization in early euarthropods (Liu et al., 2025, Scientific Reports)
DOI
「ゲノミクスにより、祖先的な左右相称動物のオプシンレパートリーに新たな視点が提供され、珍無腸形動物における感桿型光シグナル伝達が示唆される」（オープンアクセス）
Genomics Sheds New Light on the Ancestral Bilaterian Opsin Repertoire and Suggests Rhabdomeric Phototransduction in Xenacoelomorpha (Abalde & Jondelius, 2025, Genome Biology and Evolution)
DOI
「熱のタフォノミー実験により、澄江のyunnanozoansの微細構造の保存に疑問が投げかけられる」
Thermal taphonomy experiments challenge ultrastructural preservation in the Chengjiang yunnanozoans (He et al., 2025, Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences)
DOI
「脊椎動物の歯の起源と感覚外骨格の進化」（オープンアクセス）
The origin of vertebrate teeth and evolution of sensory exoskeletons (Haridy et al., 2025, Nature)
DOI
「地球最初の骨格のある動物を再構築する：Corumbella（エディアカラン紀、ブラジル）の元々の形態」（オープンアクセス）
Rebuilding Earth’s first skeletal animals: the original morphology of Corumbella (Ediacaran, Brazil) (Becker-Kerber et al., 2025, Royal Society Open Science)
DOI
「エディアカラン紀－カンブリア紀の後生動物における生殖の進化」（オープンアクセス）
The evolution of reproduction in Ediacaran–Cambrian metazoans (Wood & Droser, 2025, Biological Reviews)
DOI
「バージェス頁岩からの新たなラディオドンタ類により例証される節足動物の合体節の初期の進化可能性」（オープンアクセス）
Early evolvability in arthropod tagmosis exemplified by a new radiodont from the Burgess Shale (Moysiuk & Caron, 2025, Royal Society Open Science)
DOI
「『Omnidensの付属肢とラディオドンタ類の口器の起源』へのコメント」
Comment on: Omnidens appendages and the origin of radiodont mouthparts (McCall, 2025, Papers in Palaeontology)
DOI
「『Omnidensの付属肢とラディオドンタ類の口器の起源』へのコメントに対する返信」
Reply to Comment on: Omnidens appendages and the origin of radiodont mouthparts (Li et al., 2025, Papers in Palaeontology)
DOI
「最初期の軟体動物の系統：改善された地質年代学、改訂された相同性」（eLetter・閲覧可能）
Earliest mollusk phylogeny: Improved geochronology, revised homologies (Landing & Geyer, 2025, Science)
DOI
「Shishaniaはchancelloriidであり、カンブリア紀の軟体動物ではない」
Shishania is a chancelloriid and not a Cambrian mollusk (Yang et al., 2025, Science)
DOI
「IQ2MC：混合モデルによりIQ-TREE 3とMCMCTreeを用いて年代付けされた系統樹を推定する新たな枠組み」（プレプリント・閲覧可能）
IQ2MC: A New Framework to Infer Phylogenetic Time Trees Using IQ-TREE 3 and MCMCTree with Mixture Models (Demotte et al., 2025 preprint, EcoEvoRxiv)
DOI
「進化的速度、supertaxa、そして生きた化石」（オープンアクセス）
Evolutionary Tempo, Supertaxa and Living Fossils (Budd & Mann, 2025, Systematic Biology)
DOI
「海洋の酸化還元変化と関連した古生代初期の三葉虫類の断続的な体サイズの変動」（オープンアクセス）
Episodic body size variations of early Paleozoic trilobites associated with marine redox changes (Sun et al., 2025, Science Advances)
DOI
「形質間の速度変動を考慮したMkvモデルについて」
On the Mkv Model with Among-Character Rate Variation (Capobianco & Höhna, 2025, Systematic Biology)
DOI
「guoyi.run：最節約法の系統解析のためのワンステップなTNTスクリプト」（ResearchGateから全文のPDFが入手可能）
guoyi.run: One-step TNT script for maximum parsimony phylogenetic analysis (Zhang, 2025, Zootaxa)
DOI
ResearchGate全文PDF
「（過剰な）最適化を回避するための早期停止による最尤系統推定の高速化」（オープンアクセス）
Accelerating Maximum Likelihood Phylogenetic Inference via Early Stopping to Evade (Over-)optimization (Togkousidis et al., 2025, Systematic Biology)
DOI
「過去が消え去る時：SatuTeによる系統的シグナルの検出」（オープンアクセス）
When the Past Fades: Detecting Phylogenetic Signal with SatuTe (Manuel et al., 2025, Molecular Biology and Evolution)
DOI
「数十年にわたる研究を鳥類の一つの系統樹に統合する」
Synthesizing decades of research into one tree for birds (Stiller, 2025, Proceedings of the National Academy of Sciences)
DOI
4月
「サウスダコタ州からの新たなペルム紀前期の条鰭類および形態データの系統解析におけるrogue分類群の発見のための樹形空間の利用」（オープンアクセス）
A New Lower Permian Ray-Finned Fish (Actinopterygii) From South Dakota and the Use of Tree Space to Find Rogue Taxa in Phylogenetic Analysis of Morphological Data (Stack et al., 2025, Bulletin of the Society of Systematic Biologists)
DOI
「古生代の『羽毛様』化石の識別：藻類，ヒドロ虫類，それともフデイシ類？」（オープンアクセス）
The identification of ‘feather-like’ fossils in the Palaeozoic: Algae, hydroids, or graptolites? (Maletz et al., 2025, Palaeoworld)
DOI
「鋏角類における脚節の進化と相同性：1世紀に渡る課題に対する進化発生生物学的解決策」
Evolution and homology of leg segments in Chelicerata: Evo-devo solutions to century-old challenges (Klementz et al., 2025, Arthropod Structure & Development)
DOI
「中国北部からの新たなミャオリンギアンの管棲の化石およびエディアカラン紀の『蠕虫世界』の存続」
New Miaolingian tubicolous fossils from North China and the persistence of the Ediacaran “worm-world” (Wang et al., 2025, Palaeogeography, Palaeoclimatology, Palaeoecology)
DOI
「中国南部の最初期のカンブリア紀の海における微小硬骨格化石群の出現は塩分条件と関連していた」
Appearance of SSFs in earliest Cambrian seas of South China linked to salinity conditions (Liu & Algeo, 2025, Chemical Geology)
DOI
「total-evidenceの系統解析により、シャコ類（シャコ類）の進化の時間的尺度が解き明かされ、それらの分子的・形態的進化速度に関する洞察が得られる」（オープンアクセス）
Total-evidence phylogenetic analysis resolves the evolutionary timescale of mantis shrimps (Stomatopoda) and provides insights into their molecular and morphological evolutionary rates (Van Der Wal et al., 2025, Molecular Phylogenetics and Evolution)
DOI
「序論：Paleobiologyの50年」（オープンアクセス）
Introduction: Fifty years of Paleobiology (Patzkowsky & Kiessling, 2025, Paleobiology)
DOI
「MrBayesを使用したベイズ系統解析の包括的なプロトコル：配列アライメントからモデル選択および系統推論まで」（オープンアクセス）
A Comprehensive Protocol for Bayesian Phylogenetic Analysis Using MrBayes: From Sequence Alignment to Model Selection and Phylogenetic Inference (Wang et al., 2025, Bio-protocol)
DOI
「軟体動物の殻、骨片、軟甲は進化的に深く保存されている」（オープンアクセス）
Molluscan Shells, Spicules, and Gladii Are Evolutionarily Deeply Conserved (Barrera Grijalba et al., 2025, Journal of Experimental Zoology Part B: Molecular and Developmental Evolution)
DOI
「ヒオリテス類の生物学と解剖学における初期の個体発生および他の潜在的な軟体動物としての特徴」（オープンアクセス）
Early ontogeny and other possible molluscan traits in hyolith biology and anatomy (Dzik, 2025, Lethaia)
DOI
「地球におけるカンブリア紀の後生動物の爆発的放散についての組織のレゴブロック仮説」（オープンアクセス・中国語）
寒武纪大爆发组织拼图假说与地球后生动物门类起源
Lego Blocks of Tissues Hypothesis on the explosive radiation of Cambrian metazoans on the Earth (Zhang et al., 2025, Chinese Journal of Nature)
PDF入手可能なページ
DOI
「カンブリア爆発における脱皮動物のボディプランの起源と進化」（オープンアクセス・中国語）
寒武纪大爆发期间蜕皮动物躯体构型起源与演化
Origin and evolution of bodyplans of ecdysozoans during the Cambrian explosion (Wang et al., 2025, Chinese Journal of Nature)
PDF入手可能なページ
DOI
ResearchGate全文PDF（透かしがないためこちらの方が読みやすい）
「完全かつ動的な鳥類の系統樹」（オープンアクセス）
A complete and dynamic tree of birds (McTavish et al., 2025, Proceedings of the National Academy of Sciences)
DOI
「エディアカラン紀－カンブリア紀の区間からの、対照的な保存様式を示す2つのリボン様大型化石」（オープンアクセス）
Two ribbon-like macrofossils in contrasting preservational styles from the Ediacaran–Cambrian interval (Li et al., 2025, Journal of Palaeogeography)
DOI
「カンブリア紀中期の棘皮動物における共生関係により、後口動物上での最古の寄生関係が明らかになる」（オープンアクセス）
Symbiotic interactions on middle Cambrian echinoderms reveal the oldest parasitism on deuterostomes (Goñi et al., 2025, Scientific Reports)
DOI
「形質の依存性とimplied weightingの適用を比較した軟甲類の新たな形態系統」（オープンアクセス）
A new morphological phylogeny of Malacostraca comparing the application of character dependencies and implied weighting (Grams et al., 2025, Cladistics)
DOI
「形態データ、ゲノム系統学、そして解決困難なノード」
Morphological data, phylogenomics and recalcitrant nodes (DeSalle & Tessler, 2025, Cladistics)
DOI
「化石から系統へ：ベイズ系統推定への古生物学的データの統合を探る」（オープンアクセス）
From fossils to phylogenies: exploring the integration of paleontological data into Bayesian phylogenetic inference (Mulvey et al., 2025, Paleobiology)
DOI
「形態的に保存的な多板類において、大規模なゲノム再編成という大きな変化が潜んでいる」（オープンアクセス）
Still waters run deep in large-scale genome rearrangements of morphologically conservative Polyplacophora (Sigwart et al., 2025, eLife)
DOI
「PlaceMyFossils：バックボーン系統樹を用いて化石の系統学的配置を分析・視覚化する統合的アプローチ」（オープンアクセス）
PlaceMyFossils: An Integrative Approach to Analyze and Visualize the Phylogenetic Placement of Fossils Using Backbone Trees (Catalano et al., 2025, Systematic Biology)
DOI
「節足動物の合体節の発生と進化」（オープンアクセス）
The development and evolution of arthropod tagmata (Chipman, 2025, Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences)
DOI
「ジュラ紀の鉤頭虫類により鉤頭虫類の起源が解き明かされる」
A Jurassic acanthocephalan illuminates the origin of thorny-headed worms (Luo et al., 2025, Nature)
DOI
「Fractofusus andersoniの形態形成および初期の動物の発生の性質」（オープンアクセス）
Morphogenesis of Fractofusus andersoni and the nature of early animal development (Dunn et al., 2025, Nature Communications)
DOI
「カンブリア紀初期のArtiopoda類Acanthomeridion serratumの再評価により、durophagyに特化した頭部付属肢が明らかになる」
A reappraisal of the early Cambrian artiopod Acanthomeridion serratum reveals cephalic appendages specialized for durophagy (Wu et al., 2025, Journal of the Geological Society)
DOI
「フォーチュニアンの古杯類の海綿動物はカンブリア爆発の初期にバイオミネラリゼーションを獲得した」（オープンアクセス）
Fortunian archaeocyath sponges acquired biomineralization in the beginning of the Cambrian explosion (Wang et al., 2025, Geology)
DOI
「生命の樹：科学最大のパズルを解く」（書籍・Kindle版あり）
The Tree of Life: Solving Science’s Greatest Puzzle (Telford, 2025, John Murray Publishers Ltd or W. W. Norton & Company)
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「堅牢な系統学」（プレプリント・閲覧可能）
Robust Phylogenetics (Liu et al., 2025 preprint, bioRxiv)
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「IQ-TREE 3：複雑な進化モデルを用いたゲノム系統推論ソフトウェア」（プレプリント・閲覧可能）
IQ-TREE 3: Phylogenomic Inference Software using Complex Evolutionary Models (Wong et al., 2025 preprint, EcoEvoRxiv)
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「形態系統学における状態空間の誤特定：モデルにも節約法にも潜む落とし穴」（プレプリント・閲覧可能）
State Space Misspecification in Morphological Phylogenetics: A Pitfall for Models and Parsimony Alike (Huang, 2025 preprint, bioRxiv)
DOI
「エディアカラン紀初期の進化を天文学的に較正する」（オープンアクセス）
Astronomically calibrating early Ediacaran evolution (Zhang et al., 2025, Nature Communications)
DOI
3月
「海洋中のBa（バリウム）の除去により，約6億年前の既知最古の動物の海洋居住適正が改善された」
Oceanic Ba removal improved marine habitability for the oldest-known animals at ca. 600 Ma (Sui et al., 2025, Global and Planetary Change)
DOI
「エビの腐敗実験により，節足動物の付属肢の化石化の可能性についての洞察が提供される」（オープンアクセス）
Decay experiments on shrimps provide insight into the fossilization potential of arthropod appendages (Corthésy et al., 2025, Open Palaeontology)
DOI
「初期の真核生物の多様性：総説と再解釈」（オープンアクセス）
Early eukaryote diversity: a review and a reinterpretation (Porter et al., 2025, Paleobiology)
DOI
「分子進化遺伝学的解析のための最適な塩基置換モデルの選択におけるソフトウェアと基準の影響」（オープンアクセス）
The impact of software and criteria on the selection of best-fit nucleotide substitution models for molecular evolutionary genetic analysis (Li et al., 2025, PLoS ONE)
DOI
「新原生代～古生代の動物の多様化の潜在的推進要因としての底生域の昼夜の酸素変動とストレス」（オープンアクセス）
Benthic diel oxygen variability and stress as potential drivers for animal diversification in the Neoproterozoic-Palaeozoic (Hammarlund et al., 2025, Nature Communications)
DOI
「ニューファンドランド島のエディアカラン系からのCharniaの新種により、Charnida（ランゲオモルフ類）の分類学、純古生物学、古生態学に関する新たな洞察が得られる」
A new species of Charnia from the Ediacaran of Newfoundland reveals novel insights on the taxonomy, palaeobiology and palaeoecology of the Charnida (Rangeomorpha) (Pasinetti et al., 2025, Journal of Systematic Palaeontology)
DOI
「北グリーンランド（ローレンシア大陸）からのカンブリア紀中期（ウリューアン期）の微小硬骨格化石群」（オープンアクセス）
Middle Cambrian (Wuliuan Stage) Small Shelly Fossils from North Greenland (Laurentia) (Peel, 2025, Bulletin of Geosciences)
DOI
「汚染された宿主データから集められたミクソゾア類寄生虫のゲノムにより、広範な遺伝子配列の保存と急速な配列進化が明らかになる」（オープンアクセス）
Myxozoan parasite genomes assembled from contaminated host data reveal extensive gene order conservation and rapid sequence evolution (Weber et al., 2025, G3 Genes|Genomes|Genetics)
DOI
「脱皮動物は体節動物の子孫である」（オープンアクセス）
Ecdysozoa are descendants of Articulata (Shcherbakov, 2025, Invertebrate Zoology)
DOI
「温帯気候に対する平板動物の耐性：オーストラリア南部海域における既知および新規の平板動物のクレードの証拠」（オープンアクセス）
Tolerance of Placozoa for temperate climates: Evidence for known and new placozoan clades in the southern waters of Australia (Wright et al., 2025, PLoS ONE)
DOI
「メイオファウナ研究における根本的な疑問により、小さいが遍在する動物が、我々の自然に対する理解をいかに深めることができるかが強調される」（オープンアクセス）
Fundamental questions in meiofauna research highlight how small but ubiquitous animals can improve our understanding of Nature (Martínez et al., 2025, Communications Biology)
DOI
「大きいもの、小さいもの、奇妙なもの：現生鰓曳動物のゲノム系統解析」（オープンアクセス）
The big, the small and the weird: A phylogenomic analysis of extant Priapulida (Raeker et al., 2025, Molecular Phylogenetics and Evolution)
DOI
「例外的にconnective endoskeletonとmyoanatomyが保存された、南アフリカのスーム頁岩（オルドビス紀）ラーガーシュテッテからの新たな真節足動物」（オープンアクセス）
A new euarthropod from the Soom Shale (Ordovician) Konservat-Lagerstätte, South Africa, with exceptional preservation of the connective endoskeleton and myoanatomy (Gabbot et al., 2025, Papers in Palaeontology)
DOI
「中国南西部のエディアカラン紀のJiangchuan biotaからの、中心に輪を持つ謎めいた円盤状の大型化石」
Enigmatic discoidal macrofossils with central ring from the Ediacaran Jiangchuan biota, Southwest China (Zhao et al., 2025, Papers in Palaeontology)
DOI
「エディアカラン紀とカンブリア紀の境界の生物学的革命への新たな窓としてのChert Lagerstätten」
Chert Lagerstätten as a new window to the biological revolution across the Ediacaran−Cambrian boundary (Luo & Zhu, 2025, Geology)
DOI
「箒虫動物の幼生の触手の構造とそれらの変態による再構築、そして触手冠の起源のシナリオ」（オープンアクセス）
Organization of phoronid larval tentacles, their metamorphic remodeling, and a scenario of the lophophore origin (Temereva, 2025, Invertebrate Zoology)
DOI
「謎めいたエディアカラン紀のParvancorina minchamiの成長」（オープンアクセス）
Growth of the enigmatic Ediacaran Parvancorina minchami (Ivantsov et al., 2025, Paleobiology)
DOI
「先カンブリア時代の最後に残ったクラゲ」（オープンアクセス）
The last jellyfish of the Precambrian (Ivantsov & Zakrevskaya, 2025, Invertebrate Zoology)
DOI
2月
「カイアシ類のゲノム系統学により、カヌエラ目がハルパクチクス目とは独立した有効な目であることが支持される」
Copepod phylogenomics supports Canuelloida as a valid order separate from Harpacticoida (Bernot et al., 2025, Molecular Phylogenetics and Evolution)
DOI
「msp130遺伝子の水平伝播および後生動物の生物石灰化の進化」（オープンアクセス）
Horizontal Transfer of msp130 Genes and the Evolution of Metazoan Biocalcification (Chess et al., 2025, Genome Biology and Evolution)
DOI
「北グリーンランド（ローレンシア大陸）のSæterdal Formation（カンブリア紀シリーズ2、ステージ4）における動物相」（オープンアクセス）
Fauna of the Sæterdal Formation (Cambrian Series 2, Stage 4) of North Greenland (Laurentia) (Peel, 2025, Bulletin of the Geological Society of Denmark)
DOI
「最も希少な動物のゲノム系統学：機械学習によって特定された微顎動物2番目の種」（オープンアクセス）
Phylogenomics of the rarest animals: a second species of Micrognathozoa identified by machine learning (Sato et al., 2025, Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences)
DOI
「カナダ西部のカンブリア紀中期のperitidalなバージェス頁岩型動物相」（オープンアクセス）
A peritidal Burgess-Shale-type fauna from the middle Cambrian of western Canada (Mussini et al., 2025, Palaeontology)
DOI
「カンブリア紀の炭素質のprotoconodontsおよび毛顎動物の初期の化石記録」（オープンアクセス）
Cambrian carbonaceous protoconodonts and the early fossil record of the Chaetognatha (Slater, 2025, Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences)
DOI
「微視的なバージェス頁岩：深い海洋生物相からの小さな炭素質化石およびカンブリア紀の非鉱化動物相の分布」（オープンアクセス）
A microscopic Burgess Shale: small carbonaceous fossils from a deeper water biota and the distribution of Cambrian non-mineralized faunas (Mussini & Butterfield, 2025, Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences)
DOI
「カンブリア紀中期のステムChaetognathifera類の顎毛の多様性の拡張」（オープンアクセス）
Extending the diversity of grasping spines in middle Cambrian stem-group Chaetognathifera (Peel, 2025, Alcheringa: An Australasian Journal of Palaeontology)
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「アルメニアのデボン紀のtentaculitidsにおける保存された筋痕の純古生物学的および系統学的意味合い」
Palaeobiological and phylogenetic implications of preserved muscle scars in Devonian tentaculitids from Armenia (Vinn et al., 2025, Historical Biology)
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「カンブリア紀初期のKuamaia lata、捕食性の前部付属肢を持つArtiopodaの真節足動物」（オープンアクセス）
The early Cambrian Kuamaia lata, an artiopodan euarthropod with a raptorial frontal appendage (O’Flynn et al., 2025, Journal of Paleontology)
DOI
「ゲノムを基にした軟体動物の系統は化石と形態と一致している」（オープンアクセス）
A genome-based phylogeny for Mollusca is concordant with fossils and morphology (Chen et al., 2025, Science)
DOI
「カンブリア紀の有棘動物における風変わりなクチクラの特殊化」（オープンアクセス）
Exotic cuticular specializations in a Cambrian scalidophoran (Mussini & Butterfield, 2025, Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences)
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「例外的に保存された剛毛：カンブリア紀の冠輪動物の潜在的な形態的共有派生形質」（オープンアクセス）
Exceptionally Preserved Setae: A Possible Morphological Synapomorphy of Cambrian Lophotrochozoans (Liang et al., 2025, Evolution and Development)
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「幾何学的形態計測データの系統解析：オポッサム科における研究事例」
Phylogenetic analysis of geometric morphometric data: A study case in Didelphidae (Saguir et al., 2025, Zoologica Scripta)
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1月
「タリーモンスターは進化的に謎なままである」
The Tully monster remains an evolutionary enigma (Braddy, 2025, Geology Today)
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「ヒルナンシアン（オルドビス紀後期）のAnji Biotaからの、現生分類群に似た進歩的なクラウンツリガネカイメン科類（海綿動物：六放海綿類）」
Advanced crown-group Rossellidae (Porifera: Hexactinellida) resembling extant taxa from the Hirnantian (Late Ordovician) Anji Biota (Botting et al., 2025, Papers in Palaeontology)
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「ヤツメウナギ類のゲノム系統学的分解能により、脊椎動物の太古の系統が最近進化したことが示される」（オープンアクセス）
Phylogenomic resolution of lampreys reveals the recent evolution of an ancient vertebrate lineage (Hughes et al., 2025, Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences)
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「苔虫動物における左右相称動物のゲノムのfusion、fission、scrambling」（オープンアクセス）
Fusion, fission, and scrambling of the bilaterian genome in Bryozoa (Lewin et al., 2025, Genome Research)
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「進化：エディアカラン紀の脱皮動物」
Evolution: An Ediacaran ecdysozoan (Liu, 2025, Current Biology)
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「新たなシルル紀の有棘類の化石により軟体動物の複雑な初期の歴史が明らかになる」（オープンアクセス）
New Silurian aculiferan fossils reveal complex early history of Mollusca (Sutton et al., 2025, Nature)
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「有棘動物の腹部神経索の保存と初期進化」（オープンアクセス）
Preservation and early evolution of scalidophoran ventral nerve cord (Wang et al., 2025, Science Advances)
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「ウミグモ類（節足動物：ウミグモ類）の進化史の時間的尺度」（オープンアクセス）
A timescale for the evolutionary history of sea spiders (Arthropoda: Pycnogonida) (Nava et al., 2025, Evolutionary Journal of the Linnean Society)
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「発生学は『カマアシムシ類－姉妹群仮説』を確立できない」（オープンアクセス）
Embryology cannot establish the “Protura-sister” (Machida et al., 2025, Proceedings of the National Academy of Sciences)
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「Machida et al. への返信：発生学は『カマアシムシ類－姉妹群仮説』を確立できないが、ゲノム系統学はできる」（オープンアクセス）
Reply to Machida et al.: Although embryology cannot establish the “Protura-sister”, phylogenomics can (Du et al., 2025, Proceedings of the National Academy of Sciences)
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「非常に奇妙な初期の脊椎動物の再調査」（オープンアクセス）
Re-examining the strangest early vertebrate (Ahlberg, 2025, National Science Review)
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「多板類の軟体動物の石灰化した外骨格の初期発生および殻板と骨片の進化史への洞察」（オープンアクセス）
Early development of the calcified exoskeleton of the polyplacophoran mollusk, with insight into the evolutionary history of shell plates and spicules (Yoshikawa et al., 2025, Development, Growth & Differentiation)
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「中国の下部カンブリア系からの深い海域に生息した古虫動物」（オープンアクセス）
Deep water vetulicolians from the lower Cambrian of China (Ma et al., 2025, PeerJ)
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「アリ類の包括的な系統において、UCEデータの適切性を評価し、不確実性を統合する」（オープンアクセス）
Evaluating UCE Data Adequacy and Integrating Uncertainty in a Comprehensive Phylogeny of Ants (Borowiec et al., 2025, Systematic Biology)
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「遅く進化するタンパク質により，Craspedida（襟鞭毛虫類）の単系統性と襟鞭毛虫類の海洋起源が支持される」（オープンアクセス）
Slowly evolving proteins support the monophyly of Craspedida (Choanoflagellatea) and a marine origin of choanoflagellates (Ginés-Rivas & Carr, 2025, Protist)
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「アルメニアの上部デボン系からのtentaculitidsの化石化した軟組織：系統的類縁性の謎の解明に向けて」
Fossilized soft tissues in tentaculitids from the Upper Devonian of Armenia: Towards solving the mystery of their phylogenetic affinities (Vinn et al., 2025, Palaeoworld)
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出版月不明
「エストニアのカンブリア系最上部からの凝集した蠕虫の管の最初の記録」（オープンアクセス）
First record of agglutinated worm tubes from the uppermost Cambrian of Estonia (Vinn et al., 2025, Acta Geologica Polonica)
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